Ninja Nhật Bản được biết đến khá nhiều thông qua phim ảnh và trong điện ảnh ninja thường rất thần bí, là những sát thủ được đào tạo từ nhỏ và có rất nhiều thủ thuật ám sát cũng như chạy trốn, ẩn nấp. Tuy vậy thực tế ninja ngoài đời không thần bí như vậy, họ đích thực là những người được đào tạo từ nhỏ nhưng bằng nhiều thủ thuật khiến họ trở nên rất thần bí.
Ninja Nhật Bản xuất hiện từ thời Heian (794 – 1185), ban đầu ninja là một tổ chức chuyên đào tạo sát thủ, họ thông qua những người trung gian để nhận ám sát, mỗi một phi vụ ám sát đều có mức giá riêng, từ giết người thường cho đến những người có ảnh hưởng trong triều đình cũng được ninja nhận ám sát. Điều đáng nói là với đội quân tinh nhuệ, ninja đã thực hiện được những vụ ám sát gây ảnh hưởng rất lớn về chính trị nên tổ chức này ngày càng có tiếng tăm và thần bí.
Thân phận của ninja
Những người được đào tạo trở thành ninja thường sẽ tuyển chọn từ khi còn nhỏ, cho đến 17 tuổi thì vẫn còn là một ninja dự bị và sẽ phải trải qua một bài kiểm tra khốc liệt mới được chính thức công nhận là ninja. Ngay từ nhỏ các ninja này được học võ theo trường phái Ninjitsu, đây là một môn võ thiên về cận chiến với bộ pháp linh hoạt và những đòn đánh lấy mạng đối phương. Ngoài việc đào tạo võ học, ninja còn được đào tạo về thuật ẩn thân, chạy trốn, hóa trang, dùng độc, ám khí … Vì thế mà để một ninja phải tinh thông tất cả những thủ thuật và võ học mới được coi là ninja thực thụ.
Trang phục và vũ khí
Ninja không có trang phục cố định, vì để ám sát thành công nên ninja thường dùng thuật hóa trang để che dấu diện mạo thực, vào ban đêm ninja thường mặc những bộ đồ màu đen bó sát người và che kín khuôn mặt chỉ lộ ra hai mắt.
Vũ khí mà ninja sử dụng rất đa dạng phong phú, thậm chí để phù hợp với cách thức chiến đấu của bản thân ninja có thể tự nghĩ ra vũ khí cho bản thân. Tuy nhiên vũ khí chính mà ninja sử dụng là kantana, côn, đoản đao, dây xích, ám khí hình sao, ống thổi tiêu.
Các thủ pháp của ninja
Võ học: ninja luyện võ theo trường phái ninjitsu, sau này do học tập võ học và học thuyết của Trung Quốc truyền bá sang mà ninja chia làm 5 hệ theo thuyết ngũ hành: ninja phong, ninja thủy, ninja thổ, nija hỏa, ninja kim. Đúng như tên goi mà mỗi trường phái ninja có sở trường riêng: ninja phong thiên về tốc độ, thân pháp, ninja hỏa thiên về dùng lửa tấn công, ninja thổ với đặc trưng độn thổ, ninja thủy có thể ẩn nấp cả ngày dưới nước và ninja kim thiên về dụng ám khí phi tiêu.
Thủ pháp: ninja có rất nhiều thủ pháp, một trong số đó là ẩn thân, một kĩ thuật ẩn thân đơn giản là dùng một tấm vải được trang trí giống một bức tường hay thân cây sau đó ninja sẽ chọn những nơi mà người khác ít chú ý tới để ẩn thân. Ngoài ra thuật độn thổ của ninja cũng được coi như một bí thuật nhưng thực chất đó là các hố và hành lang được đào sẵn dưới đất, khi gặp nguy hiểm ninja sẽ nhãy xuống thông đạo đó để trốn thoát, nhiều người không biết nên vẫn coi đó mà một bí thuật của ninja.
Ninja hiện tại chỉ còn xuất hiện trong phim ảnh nhưng những gì mà ninja để lại trong lịch sử Nhật Bản rất chói lọi. Hiện nay nhiều nhà nghiên cứu vẫn đang tìm hiểu về ninja và không ngừng giải đáp những bí ẩn của ninja thông qua khoa học kĩ thuật hiện đại.